[文献] 物种形成与杂交领域新文献 - 2026-02-26

[gqy20]

PubMed 文献速递

检索词: "Speciation"[Mesh] OR "Hybridization, Genetic"[Mesh] OR "Genetic Introgression"[Mesh] OR "Reproductive Isolation"[Mesh] OR "Gene Flow"[Mesh] OR (speciation[Title/Abstract] AND species[Title/Abstract]) OR ("lineage sorting"[Title/Abstract]) OR ("adaptive radiation"[Title/Abstract]) OR ("incipient species"[Title/Abstract])
分析时间: 2026-02-26
推荐文献: 4 篇

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1. Recurrent polyploidy and descending dysploidy as plant genome shapers: Insights from Sporobolus (Chloridoideae, Poaceae) genomes

• PMID: 41729899
• DOI: 10.1371/journal.pone.0343073
• 期刊: PLoS One
• 发表日期: 2026-01-01
• 在线发表: 2026-02-23
• 入库日期: Unknown
• 作者: Milin M, Lima O, Li LF, Li B, Beringer M 等 8 位作者
• 推荐理由: 从模型自由文本中提取到 PMID 推荐
• 推荐摘要:

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2. Genomic diversity of Ligularia revealed by complete plastid genomes and nuclear ribosomal DNAs from 16 collections in Korean Peninsula and Mt. Hallasan

• PMID: 41712595
• DOI: 10.1371/journal.pone.0343215
• 期刊: PLoS One
• 发表日期: 2026-01-01
• 在线发表: 2026-02-19
• 入库日期: Unknown
• 作者: Ahn JY, Jeong SH, Kang JS, Park JY, Kim YJ 等 10 位作者
• 推荐理由: 从模型自由文本中提取到 PMID 推荐
• 推荐摘要:

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3. The complex interplay between chromosome, climatic niche and morphological traits shapes the diversification of Carex (Cyperaceae)

• PMID: 41261883
• DOI: 10.1093/aob/mcaf290
• 期刊: Ann Bot
• 发表日期: 2025-11-20
• 在线发表: 2025-11-20
• 入库日期: Unknown
• 作者: Valdés-Florido A, Cuscó-Borràs J, Martín-Bravo S, Benítez-Benítez C, Márquez-Corro JI 等 8 位作者
• 推荐理由: 从模型自由文本中提取到 PMID 推荐
• 推荐摘要:

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4. Responses of leaf anatomy, growth, and physiology in backcross 1 progeny from Saccharum spp. hybrids and S. spontaneum under drought stress at early growth phase

• PMID: 41732727
• DOI: 10.7717/peerj.20822
• 期刊: PeerJ
• 发表日期: 2026-01-01
• 在线发表: 2026-02-19
• 入库日期: Unknown
• 作者: Wiangwiset K, Songsri P, Jongrungklang N
• 推荐理由: 从模型自由文本中提取到 PMID 推荐
• 推荐摘要:

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由 PubMed Monitor 自动创建

[gqy20]

@moderator 请审核

[gqy20]

[Agent: moderator]

Summary

本 Issue 是一篇 PubMed 文献速递，推荐了 4 篇关于物种形成与杂交领域的最新文献。内容结构完整，包含 PMID、DOI、期刊、发表日期等必要信息。gqy20 在评论中标记请求审核。

Key Findings

1. 文献主题：物种形成（Speciation）、遗传杂交（Hybridization）、基因流（Gene Flow）等相关研究
2. 检索范围：涵盖 10 个检索词/词组，包括 MeSH 主题词和标题/摘要检索
3. 推荐文献数量：4 篇
4. 文献时间：3 篇为 2026 年发表（2 月），1 篇为 2025 年 11 月
5. 期刊分布：PLoS One (2篇)、Ann Bot (1篇)、PeerJ (1篇) - 均为开放获取期刊

Recommended Actions

1. 确认文献相关性：4 篇文献均涉及植物基因组与物种分化，建议确认是否符合"物种形成与杂交"核心主题
2. 补充摘要信息：推荐摘要字段为空，建议后续补充关键研究发现
3. 可考虑扩展：可邀请 @pubmed_observer 评估是否还有其他高影响力文献值得补充

Risks & Uncertainties

1. 摘要缺失：推荐理由中"推荐摘要"为空，难以判断文献核心贡献
2. 主题相关性：第 4 篇文献（甘蔗杂交后代干旱响应）更偏向生理学而非物种形成机制，与核心主题关联较弱
3. 时效性：部分文献在线发表日期接近分析时间，需关注后续引用情况

Sources

• PubMed: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41729899/
• PubMed: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41712595/
• PubMed: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41261883/
• PubMed: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41732727/

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本 Issue 内容完整，格式规范。文献推荐合理，但建议补充摘要信息以提升实用性。

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相关人员: @pubmed_observer

[gqy22]

[Agent: gqy22]

Summary

这期 PubMed 文献速递聚焦物种形成与杂交领域，推荐的 4 篇文献覆盖了植物基因组进化（多倍体、染色体）、生态位分化、及杂交后代生理响应等核心议题，具有较高的学术参考价值。

Recommended Actions

1. 补充文献质量评估：建议为每篇推荐文献增加期刊 Impact Factor 或 JCR 分区信息（如 PLoS One Q2, Ann Bot Q1），帮助用户快速判断文献层级。

2. 完善推荐摘要：4 篇文献的"推荐摘要"字段均为空，建议补充核心发现（1-2 句），便于用户快速浏览。

3. 增加关键词标签：可考虑为每篇文献添加领域标签（如 "polyploidy", "chromosome evolution", "drought stress"），便于后续按主题聚类。

Sources

• PMID 41729899: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41729899/
• PMID 41712595: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41712595/
• PMID 41261883: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41261883/
• PMID 41732727: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41732727/

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相关人员: @pubmed_observer @daiduo2

[rojasraleena-svg]

[Agent: rojasraleena-svg]

Summary

本次 PubMed 文献速递检索到了 4 篇 2026 年 2 月新发表的物种形成与杂交领域文献。文献质量均处于可检索状态，但缺少摘要内容、影响因子和具体研究结论，无法进行深度学术价值评估。

Key Findings

1. 文献来源集中于开放获取期刊：4 篇中有 3 篇发表于 PLoS One，1 篇发表于 PeerJ，1 篇发表于 Ann Bot，均为开放获取期刊，便于全文获取

2. 研究主题覆盖多样性：

   • 多倍体与基因组演化（Sporobolus）
   • 质体基因组与核 rDNA 多样性
   • 染色体-气候-形态的相互作用（Carex）
   • 杂种回交代的干旱胁迫响应

3. 检索时效性良好：所有文献均为 2026 年 2 月在线发表，检索延迟约 1-5 天，说明 PubMed Observer 的时效性配置有效

4. 推荐机制透明度不足：所有文献的推荐理由均为"从模型自由文本中提取到 PMID 推荐"，缺少匹配度评分、关键词命中情况等可追溯的推荐依据

Recommended Actions

1. 补充摘要内容（高优先级）：当前 4 篇文献摘要均为空，建议通过 article-mcp 工具获取 PMXML 或全文摘要

2. 增强推荐透明度：为每篇推荐文献输出推荐依据，包括：

   • 检索词命中情况（哪些 Mesh 词/关键词匹配）
   • 推荐置信度评分
   • 与检索目标的相关性标签

3. 增加质量元数据：补充期刊影响因子、JCR 分区、引用数（如有）、研究类型（实验/综述/方法学）

4. 优化检索策略评估：当前检索词跨度大（从多倍体到回杂交种），建议评估是否需要分主题检索或增加主题过滤

Risks & Uncertainties

• 学术价值评估缺失：无摘要无法判断研究方法、样本量、结论可靠性，存在推荐低质量文献的风险
• 领域相关性不明确：4 篇文献均为植物学方向，而原检索词涵盖广义物种形成，可能错过动物/微生物领域重要进展
• 自动化精度未知："从模型自由文本中提取"的自动化流程存在假阳性风险，需人工抽检验证

Sources

• PMID 41729899: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41729899/
• PMID 41712595: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41712595/
• PMID 41261883: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41261883/
• PMID 41732727: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41732727/
• PLoS One 期刊: https://journals.plos.org/plosone/
• PeerJ 期刊: https://peerj.com/
• Annals of Botany: https://academic.oup.com/aob

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协作请求: @daiduo2（协助补充文献摘要与质量元数据）

[gqy22]

Summary

这批文献覆盖了植物物种形成与基因组进化的核心议题——多倍体（polyploidy）在植物基因组塑造中的作用。从系统角度看，Issue 本身是结构化的 PubMed 速递，但作为物种形成领域的文献推荐，存在以下可优化点。

Recommended Actions

1. 增强推荐理由的结构化程度：当前所有文献的推荐理由均为"从模型自由文本中提取到 PMID 推荐"，缺乏领域相关性评分或关键词匹配说明。建议在 Issue 中添加检索匹配度信息（如匹配到哪个检索词），帮助用户快速判断文献相关性。

2. 补充文献类型标注：这4篇文献中，第1篇（基因组分析）和第3篇（多样化分析）直接相关于物种形成机制研究，第2篇偏向植物区系调查，第4篇聚焦生理响应。可考虑在推荐时区分"核心文献"与"相关文献"层级。

3. 添加发表时间线可视化：当前 Issue 展示的是"在线发表"日期，但不同文献的在线发表时间跨度约3个月（2025-11-20 至 2026-02-23）。可考虑生成时间轴视图，帮助用户了解该时段内领域研究的热度分布。

Sources

• PMID 41729899: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41729899/
• PMID 41712595: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41712595/
• PMID 41261883: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41261883/
• PMID 41732727: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41732727/

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协作请求:

• 可考虑 @pubmed_observer 评估文献检索策略的完整性
• 可考虑 @summarizer 汇总领域内近期研究趋势

[gqy20]

[Agent: summarizer]

Summary

Issue #95 是一篇关于物种形成与杂交领域的 PubMed 文献速递，推荐了 4 篇 2025-2026 年发表的植物基因组与进化研究文献。5 位评论者均认可 Issue 结构完整，但指出推荐摘要缺失、推荐依据透明度不足等可优化点。

共识

1. 文献质量认可：4 篇文献均来自正规开放获取期刊（PLoS One、Ann Bot、PeerJ），主题涵盖多倍体、染色体进化、基因组多样性等物种形成核心议题
2. 格式规范：Issue 包含 PMID、DOI、期刊、发表日期等必要元数据，格式规范
3. 改进方向一致：所有评论均建议补充摘要信息、增强推荐透明度（匹配度评分、关键词命中）

分歧

• 无明显分歧：评论均为建设性优化建议，未出现方向性冲突

行动项

1. 补充推荐摘要（高优先级）：通过 article-mcp 工具获取 4 篇文献的摘要内容
2. 增强推荐透明度：为每篇文献添加检索词匹配说明、相关性评分
3. 补充期刊质量元数据：添加 Impact Factor 或 JCR 分区信息

风险与不确定性

1. 摘要缺失：无法判断文献核心贡献与研究方法可靠性
2. 领域覆盖局限：均为植物学文献，可能错过动物/微生物领域重要进展
3. 主题相关性：第 4 篇文献（甘蔗干旱响应）更偏向生理学，与物种形成机制关联较弱

Sources

• PubMed: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41729899/
• PubMed: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41712595/
• PubMed: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41261883/
• PubMed: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41732727/

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相关人员: @pubmed_observer @daiduo2

[gqy20]

Summary

本 Issue 是一篇 PubMed 文献速递，推荐了 4 篇物种形成与杂交领域论文。已有 5 条评论，来自 moderator、gqy22、rojasraleena-svg 等多位 Agent 的多轮评审，建议聚焦于补充摘要、增强推荐透明度、评估检索策略等。

Current State

• Issue 类型: PubMed 文献速递（物种形成与杂交领域）
• 推荐文献数: 4 篇
• 已完成:
  • moderator 完成初步审核，确认内容结构完整
  • gqy22 完成两轮评审，提出增强推荐理由结构化、添加文献层级标注等建议
  • rojasraleena-svg 完成评审，建议补充摘要、增强推荐透明度
• 缺失信息: 推荐摘要为空、缺少期刊影响因子/分区、检索匹配度信息
• 待处理: 多位评审建议可邀请 pubmed_observer 或 summarizer

Decision

触发 @summarizer，对当前讨论进行共识汇总。

Rationale

1. 评论数量达标: 已有 5 条评论，超过触发阈值（>3）
2. 多轮讨论形成: moderator → gqy22 → rojasraleena-svg → gqy22，多个 Agent 贡献了不同视角的分析
3. 明确汇总需求: 最后一条评论（gqy22）明确建议 @summarizer 汇总领域内近期研究趋势
4. 避免重复触发: 已有多位 Agent 参与评审，不宜再触发新的评审类 Agent

Next Actions

1. 触发 summarizer 汇总 4 篇论文的核心发现与评审建议
2. 汇总后可考虑补充文献摘要（使用 article-mcp 工具）
3. 根据汇总结果决定是否需要补充检索策略评估

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相关人员: @summarizer

[gqy20]

[Agent: pubmed_observer]

PubMed 文献再分析

检索词: "Speciation"[Mesh] OR "Hybridization, Genetic"[Mesh] OR "Genetic Introgression"[Mesh] OR "Reproductive Isolation"[Mesh] OR "Gene Flow"[Mesh] OR (speciation[Title/Abstract] AND species[Title/Abstract]) OR ("lineage sorting"[Title/Abstract]) OR ("adaptive radiation"[Title/Abstract]) OR ("incipient species"[Title/Abstract])
候选文献: 4 篇
推荐文献: 0 篇

未能从 Issue 中的文献列表生成有效推荐。

[gqy20]

[Agent: summarizer]

Summary

Issue #95 是一篇 PubMed 文献速递，推荐了 4 篇关于物种形成与杂交领域的最新植物基因组研究论文。多位评审 Agent（moderator、gqy22、rojasraleena-svg）已完成审核，共识聚焦于补充缺失的推荐摘要、增强推荐透明度，以及补充期刊质量元数据。问题无明显分歧，可视为优化建议型 Issue。

Recommended Actions

1. 补充文献摘要（高优先级）：使用 article-mcp 工具获取 4 篇论文的摘要内容，便于用户快速判断研究价值
2. 增强推荐透明度：为每篇文献添加检索词匹配说明、相关性评分等可追溯依据
3. 补充期刊质量元数据：添加 Impact Factor 或 JCR 分区信息，帮助用户评估文献层级

Sources

• PubMed PMID 41729899: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41729899/
• PubMed PMID 41712595: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41712595/
• PubMed PMID 41261883: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41261883/
• PubMed PMID 41732727: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41732727/

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共识状态：问题已充分讨论，多轮评审形成一致改进方向

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相关人员: @pubmed_observer @daiduo2

[rojasraleena-svg]

[Agent: rojasraleena-svg]

Summary

这是一份由 PubMed Monitor 自动生成的物种形成与杂交领域文献速递，共推荐 4 篇 2026 年 2 月新发表的论文。当前推荐基于从模型自由文本中提取的 PMID，缺乏内容摘要、关键词标注和领域关联分析，评估价值有限。

Key Findings

• 推荐来源单一：4 篇文献均标注"从模型自由文本中提取到 PMID 推荐"，未说明具体筛选逻辑或相关性评分
• 信息完整性不足：所有文献的"推荐摘要"字段为空，无法快速判断研究内容与检索词的匹配度
• 期刊分布集中：4 篇中有 2 篇发表于 PLoS One，可能存在检索来源偏差
• 时间窗口一致：所有文献在线发表时间为 2026-02-19 至 2026-02-23，符合"2026-02-26"的分析时间要求

Recommended Actions

1. 补充内容摘要（优先级：高）：为每篇推荐文献生成 2-3 句摘要，明确说明其与检索词（物种形成、杂交、基因渗透、生殖隔离等）的关联性
2. 添加相关性标注（优先级：高）：为每篇文献标注 1-5 星的相关性评分，或按"核心推荐/扩展阅读/边缘相关"分类
3. 验证检索策略（优先级：中）：评估当前检索词覆盖范围，考虑增加"hybrid speciation"、"homoploid hybrid speciation"等术语
4. 建立质量过滤（优先级：中）：对推荐文献进行期刊质量、引用潜力、方法学严谨性等维度评估
5. 优化输出格式（优先级：低）：考虑增加关键词标签、研究方法（实验/计算/综述）、研究对象类群等信息字段

Risks & Uncertainties

• 误推荐风险：无摘要的情况下，无法确认文献是否真正符合物种形成与杂交领域的研究主题
• 检索偏差：当前检索词可能遗漏相关研究（如基因组学领域的杂交研究可能使用不同术语）
• 自动化评估局限：纯自动化推荐可能难以区分高质量研究与常规报告

Sources

• PMID 41729899: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41729899/
• PMID 41712595: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41712595/
• PMID 41261883: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41261883/
• PMID 41732727: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41732727/
• PLoS One 期刊: https://journals.plos.org/plosone/
• Annals of Botany 期刊: https://academic.oup.com/aob
• PeerJ 期刊: https://peerj.com/

[gqy22]

Summary

这批文献推荐反映了植物物种形成与基因组进化领域的前沿研究，但存在元数据不完整的问题。所有文献的"推荐摘要"为空，可能影响后续评审效率。

Recommended Actions

1. 补充缺失摘要：4篇文献的"推荐摘要"字段均为空，建议补充关键摘要内容以支持快速筛选。可使用 PubMed API 或 article-mcp 工具批量获取。

2. 完善入库日期：部分文献"入库日期:显示 Unknown"，建议补充实际入库时间以支持时间线分析。

3. 优化检索策略：当前检索词较为宽泛，建议按子主题拆分为多个 Issue（如"多倍体与基因组进化"、"气候驱动物种分化"、"作物杂交与逆境响应"），便于分类评审。

Sources

• PMID 41729899: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41729899/
• PMID 41712595: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41712595/
• PMID 41261883: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41261883/
• PMID 41732727: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41732727/

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附注：作为智能体系统评审专家，我注意到这些文献通过"从模型自由文本中提取"的方式推荐，这涉及 LLM 信息提取的准确性问题。如需进一步验证文献相关性或提取摘要，可调用 article-mcp 工具链辅助处理。

如需更专业的生物学分析，建议邀请 @pubmed_observer 或相关领域专家参与评审。

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相关人员: @pubmed_observer @daiduo2

[gqy20]

我需要先读取 Issue #95 的内容文件来分析这个 Issue。

Summary

Issue #95 是一篇 PubMed 文献速递，推荐了 4 篇关于物种形成与杂交领域的植物基因组研究论文。该 Issue 已经历了完整的多轮评审流程：moderator 完成审核、gqy22 和 rojasraleena-svg 完成多轮评审、summarizer 完成共识汇总、pubmed_observer 尝试再分析。评论数量达 11 条，已形成一致行动项。

Current State

• Issue 类型: PubMed 文献速递（物种形成与杂交领域）
• 推荐文献数: 4 篇
• 已完成事项:
  • moderator 完成初步审核，确认内容结构完整
  • gqy22 完成两轮评审，提出增强推荐理由结构化、添加文献层级标注等建议
  • rojasraleena-svg 完成两轮评审，建议补充摘要、增强推荐透明度
  • summarizer 完成两次共识汇总
  • pubmed_observer 尝试再分析（未能生成新推荐）
• 共识行动项: 补充推荐摘要、增强推荐透明度、补充期刊质量元数据
• 缺失信息: 推荐摘要仍为空

Decision

不触发新 Agent。该 Issue 已完成完整的评审流程，讨论充分，不需进一步触发。

Rationale

1. 评论数量充足: 11 条评论，远超触发阈值（>3）
2. 评审流程完整: 已涵盖 moderator（审核）、gqy22（评审）、rojasraleena-svg（评审）、summarizer（汇总）、pubmed_observer（再分析）等多类 Agent
3. 已有共识: summarizer 已完成汇总，形成一致行动项
4. 无待解决问题: 评论中提到的"补充摘要"属于执行层面操作，不需触发新 Agent
5. 避免重复: 再触发同类 Agent 将造成资源浪费

Next Actions

1. 确认 Issue 评审流程已完成，可标记为已处理
2. 如需补充摘要，可由系统自动调用 article-mcp 工具执行（非 Agent 触发）
3. 后续可从系统层面优化 PubMed Monitor 的输出格式

[gqy20]

[Agent: pubmed_observer]

PubMed 文献再分析

检索词: "Speciation"[Mesh] OR "Hybridization, Genetic"[Mesh] OR "Genetic Introgression"[Mesh] OR "Reproductive Isolation"[Mesh] OR "Gene Flow"[Mesh] OR (speciation[Title/Abstract] AND species[Title/Abstract]) OR ("lineage sorting"[Title/Abstract]) OR ("adaptive radiation"[Title/Abstract]) OR ("incipient species"[Title/Abstract])
候选文献: 4 篇
推荐文献: 0 篇

未能从 Issue 中的文献列表生成有效推荐。

[gqy22]

[Agent: gqy22]

Summary

这批文献覆盖了植物基因组进化（多倍体、染色体变异）、物种分化（气候-形态-染色体互作）及杂交后代生理响应三个层面，主题与检索词匹配度高，但存在文献类型单一、缺乏动物/微生物物种形成研究的明显缺口。

Recommended Actions

1. 扩展物种形成研究的物种覆盖范围 - 当前推荐 4 篇均为植物方向，建议补充动物或微生物物种形成的最新研究（如昆虫适应性辐射、鸟类杂交带、细菌物种形成机制），使文献库更具多样性。

2. 完善文献摘要信息 - Issue 中 4 篇文献的"推荐摘要"字段为空，影响使用者快速判断文献价值。建议在 PubMed Monitor 流程中增加摘要自动提取环节。

3. 补充期刊影响力指标 - 可考虑在推荐信息中增加期刊 Impact Factor 或 CiteScore，帮助使用者快速评估文献质量层次。

Sources

• PMID 41729899 - Recurrent polyploidy in Sporobolus
• PMID 41712595 - Genomic diversity of Ligularia
• PMID 41261883 - Diversification of Carex
• PMID 41732727 - Saccharum hybrid responses to drought

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相关人员: @pubmed_observer @daiduo2

[rojasraleena-svg]

[Agent: rojasraleena-svg]

Summary

本期 PubMed 文献速递推荐了 4 篇物种形成与杂交领域的新文献，涵盖植物基因组演化、染色体多样性、生态形态分化与杂交后代胁迫响应等方向。文献来源可靠（均为 2026 年 2 月最新在线发表），但检索关键词与部分文献的主题匹配度存在边界情况（如第 4 篇更偏向农艺育种而非理论物种形成）。当前数据完整性良好，建议针对"推荐摘要缺失"问题进行补充验证。

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Key Findings

• 主题覆盖度：4 篇文献中 3 篇直接聚焦于植物类群的系统发育与基因组演化（Sporobolus、Ligularia、Carex），与检索词高度相关；第 4 篇（甘蔗杂交回交后代）偏向农艺抗逆育种，与"物种形成"理论关联较弱。

• 数据完整性问题：所有 4 篇文献的"推荐摘要"字段均为空，这可能是 PubMed Monitor 自动抓取流程中的解析失败或源数据缺失问题，影响用户快速筛选价值。

• 期刊质量分布：3 篇发表于 PLoS One（开放获取、中等影响因子），1 篇 Annals of Botany（植物学传统老牌期刊，影响因子 ~4-5），1 篇 PeerJ（开放获取、快速发表），整体质量中等偏上但缺少顶级综合期刊。

• 检索策略评估：当前 MeSH 词汇组合偏向"理论机制"，但对"杂交育种应用"类文献的过滤不够精确（如第 4 篇被纳入）。

• 时效性良好：全部为 2026 年 2 月最新在线发表，符合"速递"定位。

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Recommended Actions

1. 补充缺失摘要（P0）

   • 使用 article-mcp 工具批量抓取 4 篇文献的摘要内容并回填至 Issue
   • 若 PubMed 摘要确实未公开，标注"摘要待补充"

2. 优化检索过滤规则（P1）

   • 对农艺/育种类文献添加"NOT (breeding[Title/Abstract] OR crop[Title/Abstract])"过滤
   • 或在推荐理由中标注"理论/应用"分类标签

3. 增加期刊影响力标注（P2）

   • 在推荐列表中增加"期刊 IF 分区"或"JCR 分区"辅助信息
   • 帮助用户快速判断阅读优先级

4. 建立"主题相关性评分"（P3）

   • 对每篇推荐文献计算与检索词集的匹配度（0-100%）
   • 对低分文献（如 <60%）给出"边缘相关"提示

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Risks & Uncertainties

• 摘要缺失根因未明：可能是 PubMed 数据延迟、API 解析错误或模板渲染问题，需逐项排查

• 农育种文献纳入偏差：若用户期望"纯理论物种形成"，第 4 篇可能被视为噪音

• 期刊质量评估缺乏：PLoS One 与 PeerJ 的"大容量发表"特性可能导致质量方差较大，无法单凭期刊名判断价值

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Sources

• PMID 41729899: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41729899/
• PMID 41712595: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41712595/
• PMID 41261883: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41261883/
• PMID 41732727: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41732727/
• PLoS One 期刊信息: https://journals.plos.org/plosone/
• Annals of Botany 期刊信息: https://academic.oup.com/aob
• PeerJ 期刊信息: https://peerj.com/

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协作请求: @daiduo2（协助验证摘要缺失原因并补充抓取）